Resumen

Antecedentes. El cáncer de cuello de útero (CC) es una neoplasia maligna importante que afecta a mujeres de todo el mundo, con opciones de tratamiento limitadas para pacientes con enfermedad avanzada. El objetivo de este estudio fue identificar nuevos biomarcadores pronósticos para el CC. Métodos. Se utilizaron datos de RNA-Seq de cuatro conjuntos de datos de Gene Expression Omnibus (GSE5787, GSE6791, GSE26511 y GSE63514) para identificar genes expresados diferencialmente (DEG) entre el CC y los tejidos cervicales normales. Se realizaron análisis funcionales y de enriquecimiento de los DEG utilizando la base de datos Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins (STRING) y la Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery (DAVID). La base de datos Oncomine, el software Cytoscape y los análisis de supervivencia de Kaplan-Meier se utilizaron para el cribado en profundidad de los DEG hub. A continuación, se utilizó la regresión de Cox para desarrollar una firma pronóstica, que a su vez se utilizó para crear un nomograma. Resultados. Se identificaron un total de 207 DEG en las muestras de tejido, ocho de los cuales eran significativos desde el punto de vista pronóstico en términos de supervivencia global (SG). Posteriormente, se desarrolló y validó una nueva firma de cuatro genes compuesta por DSG2, MMP1, SPP1 y MCM2 mediante un análisis de Cox por pasos. Los valores del área bajo la curva receiver operating characteristic (ROC) (AUC) fueron de 0,785, 0,609 y 0,686 en los grupos de entrenamiento, verificación y combinación, respectivamente. Los niveles de expresión proteica de los cuatro genes fueron bien validados por el western blotting. Además, el análisis del nomograma mostró que una combinación de esta firma de cuatro genes más el estado de la metástasis en los ganglios linfáticos (LNM) predecía eficazmente las probabilidades de SG a 1 y 3 años de los pacientes con CC con una precisión del 69,01 y 83,93%, respectivamente. Conclusiones. Hemos desarrollado una firma de cuatro genes que puede predecir con exactitud el pronóstico en términos de SG, de los pacientes con CC, y podría ser una herramienta valiosa para el diseño de estrategias de tratamiento.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Genomics Genomic instability Genetic polymorphism
• Palabras claves:firma génica, DEG, pacientes con CC, conjuntos de datos Gene Expression Omnibus, análisis de supervivencia de Meier, opciones de tratamiento limitadas, metástasis en ganglios linfáticos, tejidos cervicales normales, nuevos biomarcadores pronósticos, niveles de expresión proteica.
• Keywords:gene signature, DEGs, CC patients, Gene Expression Omnibus datasets, Meier survival analyses, limited treatment options, lymph node metastasis, normal cervical tissues, novel prognostic biomarkers, protein expression levels