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A Novel Pathway for the Biosynthesis of Heme in Archaea: Genome-Based Bioinformatic Predictions and Experimental EvidenceUna nueva vía para la biosíntesis del hemo en las arqueas: predicciones bioinformáticas basadas en el genoma y pruebas experimentales

Resumen

El hemo es un grupo prostético esencial para muchas proteínas implicadas en procesos biológicos fundamentales en los tres dominios de la vida. En los eucariotas y las bacterias, el hemo se forma a través de una vía biosintética conservada y bien estudiada. Sorprendentemente, en Archaea la biosíntesis del hemo se realiza por una vía alternativa que no se conoce bien. Con el fin de formular una hipótesis de trabajo para esta nueva vía, buscamos en 59 genomas de arqueas completamente secuenciados la presencia de grupos de genes consistentes en genes biosintéticos del hemo establecidos y genes candidatos conservados colocalizados. En la mayoría de los genomas de las arqueas fue posible identificar estos grupos de genes de biosíntesis del hemo. A partir de este análisis hemos podido identificar varios genes nuevos de biosíntesis del hemo que están restringidos a las arqueas. Curiosamente, varias de las proteínas codificadas muestran similitud con las enzimas implicadas en la biosíntesis del hemo d1. Para iniciar una verificación experimental de nuestras propuestas, se produjeron recombinantemente dos proteínas de Methanosarcina barkeri que se predijo que catalizarían los pasos iniciales de la biosíntesis del hemo en las arqueas, se purificaron y se verificaron sus funciones enzimáticas previstas.

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