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The Utilization of Formalin Fixed-Paraffin-Embedded Specimens in High Throughput Genomic StudiesUtilización de muestras fijadas en formol e incluidas en parafina en estudios genómicos de alto rendimiento

Resumen

Los ensayos genómicos de alto rendimiento nos permiten estudiar todo el genoma humano en poco tiempo y con un coste razonable. El procesamiento de tejidos fijados en formol e incluidos en parafina (FFPE) sigue siendo el método más económico para el almacenamiento longitudinal de muestras de tejidos. Por lo tanto, la capacidad de aplicar aplicaciones genómicas de alto rendimiento a muestras FFPE puede ampliar los ensayos clínicos y los descubrimientos. Muchos estudios han medido la precisión y la repetibilidad de los datos generados a partir de muestras FFPE utilizando ensayos genómicos de alto rendimiento. En conjunto, estos estudios demuestran la viabilidad y proporcionan una orientación crucial para futuros estudios que utilicen muestras FFPE. Aquí resumimos los hallazgos de estos estudios y analizamos las limitaciones de los datos de alto rendimiento generados a partir de muestras FFPE en varias plataformas que incluyen microarrays, secuenciación de alto rendimiento y NanoString.

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