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Validation of Simple Sequence Length Polymorphism Regions of Commonly Used Mouse Strains for Marker Assisted Speed Congenics ScreeningValidación de regiones de polimorfismo de longitud de secuencia simple de cepas de ratón de uso común para el cribado de congéneres de velocidad asistida por marcadores

Resumen

La técnica de congenia rápida asistida por marcadores se utiliza habitualmente para facilitar el retrocruzamiento de cepas de ratón en casi la mitad del tiempo que normalmente se tardaría de otro modo. Tradicionalmente, la técnica se realiza analizando regiones amplificadas por PCR de marcadores de polimorfismo de longitud de secuencia simple (SSLP) entre las cepas receptora y donante: la descendencia con el mayor número de marcadores que muestra el genoma receptor en todos los cromosomas se elige para la siguiente generación. Aunque existen paneles bien definidos de marcadores SSLP establecidos entre determinados pares de cepas de ratones, son incompletos para la mayoría de las cepas. La disponibilidad de conjuntos de marcadores bien establecidos para realizar cribas congénicas rápidas permitiría a la comunidad científica transferir mutaciones entre cepas. En este estudio, probamos la idoneidad de más de 400 conjuntos de marcadores SSLP entre 10 cepas de ratón utilizadas habitualmente para generar modelos de ingeniería genética. El panel de marcadores aquí presentado puede identificar fácilmente las cepas especificadas y será muy útil en las cribas congénicas de velocidad asistida por marcadores. Además, a diferencia de los nuevos métodos de matriz de polimorfismo de nucleótido único (SNP), que requieren equipos sofisticados, el panel de marcadores SSLP aquí descrito sólo utiliza la PCR y la electroforesis en gel de agarosa de los productos amplificados, por lo que puede realizarse en la mayoría de los laboratorios de investigación.

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Información del documento

  • Titulo:Validation of Simple Sequence Length Polymorphism Regions of Commonly Used Mouse Strains for Marker Assisted Speed Congenics Screening
  • Autor:Channabasavaiah B., Gurumurthy; Poonam S., Joshi; Scott G., Kurz; Masato, Ohtsuka; Rolen M., Quadros; Donald W., Harms; K. C. Kent, Lloyd
  • Tipo:Artículo
  • Año:2015
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi Publishing Corporation
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
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