Se secuenciaron aproximadamente 2,4 kbp de ADN mitocondrial de 9 individuos de Uromastyx ornata philbyi originarios de Taif, Namas, Al-Baha y Jazan, en el suroeste de Arabia Saudí. Las regiones secuenciadas abarcan ocho genes de ARNt (tRNAGln, tRNAIle, tRNAMet, tRNATrp, tRNAAla, tRNAAsn, tRNACys y tRNATyr) y dos genes codificadores de proteínas (NADH deshidrogenasa subunidad 2 y citocromo b). U. ornata philbyi tenía una inserción de 170 pb de longitud entre los genes tRNAGln y tRNAIle. Los primeros 128 pb de esta inserción eran similares a los identificados anteriormente en U. ornata ornata y pueden plegarse en una estructura de tallo y bucle, que era menos estable en U. ornata philbyi que en U. ornata ornata, o en el segundo gen tRNAGln. Los siguientes 42 pb de la inserción eran únicos en U. ornata philbyi y además conservaban una estructura estable de tallo y bucle. La mayoría de las sustituciones de bases encontradas en los genes secuenciados fueron transiciones sinónimas en lugar de transversiones. Los análisis arbóreos apoyaron la relación de grupo hermano entre las dos subespecies de U. ornata y dividieron a U. ornata philbyi en dos grupos: El grupo Taif Namas en el este de Sarawat y el grupo Al-Baha Jazan en el oeste de Sarawat. Estos datos moleculares concuerdan con la clasificación actual de U. ornata.
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