oncoNcRNA: A Web Portal for Exploring the Non-Coding RNAs with Oncogenic Potentials in Human Cancers

oncoNcRNA: Portal web para exploración de RNAs no codificante con potencial oncogénico en cáncer humano

Este estudio tiene como objetivo el desarrollo del portal oncoNcRNA para explorar el potencial oncogénico del RNA no codificante (ncRNAs) a partir de una base de datos que comprende información a gran escala de alteraciones en el número de copias somáticas (SCNA) en cáncer humano. El portal consiste en la integración a gran escala de datos de SCNA públicos y proporciona la información de SCNA de todos los ncRNA bien anotados en hasta 64 tipos de cáncer humano. Esto permite a los investigadores analizar de manera rápida e intuitiva el potencial oncogénico de los ncRNAs de interés, de hecho, fue descubierto un gran número de ncRNAs que son amplificados o eliminados con frecuencia dentro y entre los diferentes tipos de tumores. Adicionalmente, los autore proporcionan una herramienta de correlación para explorar la relación entre expresión génica y el número de copias de alrededor de 10000 muestras tumorales en 36 tipos de cáncer identificados por The Cancer Genome Atlas (TCGA).