Bioinformática
Bioingeniería
Small Genomes and Big Data: Adaptation of Plastid Genomics to the High-Throughput Era
Genomas pequeños y Big Data: Adaptación de la genómica de plastidios a la era de alto rendimiento
Este es un artículo de revisión enfocado en la importancia de la disponibilidad de secuencias genómicas de algas y plantas en el campo de investigación. El documento toma como ejemplo dos casos de estudio donde se muestra cómo la disponibilidad pública de las secuencias genómicas de algas y plantas ha respaldado hipótesis previamente sostenidas sobre rasgos de plastidios en experimentos de linaje restringido a través de la diversidad de algas y plantas. Los autores también proponen el uso de este abordaje en diferentes disciplinas para inferir características funcionales y biológicas de los enfoques genómicos, incluyendo la integración de nuevos enfoques computacionales y bioinformáticos, como el machine learning.
Este artículo fue elaborado por Christen M. Klinger y Elisabeth Richardson (University of Alberta, Edmonton, Canada) para Biomolecules (vol. 9, núm. 8, p. 299, 2019), revista enfocada en estudios sobre sustancias biogénicas como proteínas, enzimas, ácidos nucleicos, polisacáridos, membranas, lípidos, entre otras. Esta es una publicación de MDPI, una plataforma de revistas científicas de acceso abierto operada por MDPI Verein (Basileia, Suiza). Correo de contacto: [email protected]
Identification of Prognostic Candidate Genes in Breast Cancer by Integrated Bioinformatic Analysis
Identificación de genes potenciales para pronóstico de cáncer de mama por medio del análisis bioinformático integrado
Dada la necesidad de estudiar a fondo los mecanismos moleculares de patogenicidad del cáncer, este estudio se enfoca en la identificación de genes de pronóstico asociados con la progresión del cáncer de mama. Para esto, fue realizado un análisis bioinformático integrado a través del análisis ponderado de redes de co-expresión génica a fin de construir redes de co-expresión, evaluar asociaciones entre grupos de genes y características clínicas e identificar biomarcadores potenciales. Como resultado, fueron identificados cuatro módulos de la red de co-expresión, uno de los cuales está significativamente asociado con el tiempo de supervivencia del paciente y ocho biomarcadores identificados para la comprensión de la patogenicidad molecular.
Este artículo fue elaborado por Charles C.N. Wang (Asia University, Taichung, Taiwan), Chia Ying Li (National Chung Hsing University, Taichung , Taiwan), Jia-Hua Cai (Asia University, Taichung, Taiwan), Phillip C.-Y. Sheu (University of California, Irvine, USA), Jeffrey J.P. Tsai (Asia University, Taichung, Taiwan), Meng-Yu Wu (Tzu Chi University, Hualien, Taiwan), Chia-Jung Li (Sun Yat-Sen University, Kaohsiung, Taiwan), y Ming-Feng Hou ( Kaohsiung Medical University, Kaohsiung, Taiwan) para Journal of Clinical Medicine (vol. 8, núm. 8, p.1160, 2019), revista enfocada en investigaciones en el área de la medicina. Esta es una publicación de MDPI, una plataforma de revistas científicas de acceso abierto operada por MDPI Verein (Basileia, Suiza). Correo de contacto: [email protected]
Comparative Proteomics and Physiological Analyses Reveal Important Maize Filling-Kernel Drought-Responsive Genes and Metabolic Pathways
Análisis comparativo proteómico y fisiológico revela genes y rutas metabólicas importantes en la fase de llenado del grano de maíz y respuestas a desecación.
Este documento muestra un análisis proteómico comparativo de los granos de maíz de dos tipos (tolerante a sequía YE8112 y sensible a la sequía MO17) considerando los factores moleculares esenciales para mediar la tolerancia a la sequía en el maíz. Fueron identificados cuatro grupos importantes de proteínas sensibles a la sequía de un total de 5175 proteínas diferencialmente abundantes (DAPs). Fue evidenciado que las proteínas DAP del tipo YE8112 están asociadas principalmente en rutas de procesamiento proteico en el retículo endoplasmático así como el metabolismo del triptófano, mientras que para el tipo MO17 las DAPs están involucradas en las rutas metabólicas del almidón y sacarosa y la fosforilación oxidativa. Los granos YE8112 son más resistentes a la sequía a causa de modificaciones redox post translacionales y mecanismos de regulación epigenéticos, además de la elevada expresión de proteínas de choque térmico, metabolismo energético enriquecido, biosíntesis de metabolitos secundarios y regulación en la expresión de proteínas de almacenamiento en las semillas
Este artículo fue preparado por Xuan Wang, Tinashe Zenda, Songtao Liu, Guo Liu, Hongyu Jin, Liang Dai, Anyi Dong, Yatong Yang y Huijun Duan (Hebei Agricultural University, Baoding, China) para International Journal of Molecular Sciences (vol. 20, núm. 15, p. 3743, 2019), revista enfocada en estudios sobre bioquímica, biología celular y molecular. Esta es una publicación de MDPI, una plataforma de revistas científicas de acceso abierto operada por MDPI Verein (Basileia, Suiza). Correo de contacto: [email protected]
