Determining Enzyme Kinetics for Systems Biology with Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy
Determinación de cinética enzimática para sistemas biológicos a través de espectroscopia de resonancia magnética nuclear
Esta publicación propone un método relativamente rápido y efectivo para la obtención de parámetros cinético-enzimáticos a partir de la datos de metabolitos generados en un periodo de tiempo por espectroscopía NMR. Este método requiere menos corridas en comparación con estudios tradicionales y genera más información por experimento, al realizar un análisis de la totalidad del tiempo transcurrido y, a partir de este, el ajuste de los parámetros. Los autores aclaran que el método permite realizar una cuantificación simultánea en tiempo real de todos los metabolitos presentes en el sistema de prueba (incluyendo productos y modificadores alostéricos), demostrando la superioridad del NMR sobre los ensayos tradicionales de espectrofotometría. El método es aplicado en este estudio para evidenciar los parámetros cinéticos de dos enzimas glicolíticas de E. coli (fosfoglucosa isomerasa y fosfofructoquinasa) donde el procesamiento de los datos cinéticos se realiza a través de un software personalizado, codificado en el lenguaje de programación Phyton y que se ajusta adecuadamente a las ecuaciones Hill modificadas a nivel mundial.
Este artículo fue elaborado por Johann J. Eicher(Stellenbosch University, Matieland, South Africa),Jacky L. Snoep(Stellenbosch University, Matieland, South Africa,Vrije Universiteit, Amsterdam,The Netherlands,The University of Manchester,Manchester, UK), y Johann M. Rohwer(Stellenbosch University, Matieland, South Africa) para Metabolites (vol. 2, núm. 4, p. 818-843, 2012), revista enfocada en estudios sobre aspectos moleculares del metabolismo de relevancia en las áreas de metabolómica, bioquímica, bioinformática, sistemas biológicos, biotecnología y medicina. Esta es una publicación de MDPI, una plataforma de revistas científicas de acceso abierto operada por MDPI Verein (Basileia, Suiza). Correo de contacto: [email protected]
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Idioma:inglés
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Fuzzy-Enhanced Modeling of Lignocellulosic Biomass Enzymatic Saccharification
Modelo de difusión mejorada para sacarificación enzimática de biomasa lignocelulósica
Aunque los modelos cinéticos de Michaelis-Menten y Langmuir han sido utilizados para describir procesos discontinuos, resulta difícil su adaptación para predecir operaciones continuas bajo diversas condiciones de alimentación. En este contexto, los autores de este estudio hacen la propuesta de un modelo de difusión FM (del inglés Fuzzy Model) para describir la sacarificación enzimática del bagazo de caña de azúcar respecto a la tasa de reacción. Este enfoque parece ser una buena compensación entre los modelos fenomenológicos y empíricos y puede ser aplicada a diferentes sistemas tales como licuefacción enzimática de otros materiales lignocelulósicos.
Este artículo fue preparado por Vitor B. Furlong (University of São Carlos, São Carlos, Brazil), Luciano J. Corrêa (Federal University of Lavras, Lavras, Brazil), Roberto C. Giordano (University of São Carlos, São Carlos, Brazil) y Marcelo P. A. Ribeiro (University of São Carlos, São Carlos, Brazil) para Energies (vol. 12, núm. 11, p. 2110, 2019), revista enfocada en estudios sobre desarrollo tecnológico, gestión y políticas energéticas. Esta es una publicación de MDPI, una plataforma de revistas científicas de acceso abierto operada por MDPI Verein (Basileia, Suiza). Correo de contacto: [email protected]
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