Enzimología e ingeniería de proteínas
Microbiología, bioingeniería y biotecnología
Metaproteomics reveals enzymatic strategies deployed by anaerobic microbiomes to maintain lignocellulose deconstruction at high solids
Metaproteómica revela estrategias enzimáticas desplegadas por microbiomas anaeróbios para mantener la deconstrucción de lignocelulosa con alto contenido de sólidos
Este estudio investiga mediante mediciones metaproteómicas basadas en LC-MS/MS los mecanismos de deconstrucción de lignocelulosa en cargas de sólidos representativas para un proceso industrial. La metodología se basa en el enriquecimiento de un microbioma metanogénico anaerobio, termofílico, alimentado semicontinuamente, cultivado durante un período prolongado (550 días). Durante ese periodo fueron realizados muestreos en varias cargas de sólidos en estado estacionario, y fue realizado el seguimiento del rendimiento de solubilización con el incremento de sólidos, cambios en la presencia de enzimas CAZ entre fracciones y detalles de las rutas metanogénicas. El análisis metaproteómico reveló importantes incrementos en la abundancia de clases específicas de enzimas activas de carbohidratos. Asimismo, fue posible obtener información sobre los mecanismos mediante los cuales los microbiomas degradan y utilizan la celulosa a una alta carga de sólidos, lo cual sugiere el futuro desarrollo de cultivos definidos para la bioconversión eficiente.
Este trabajo fue desarrollado por Payal Chirania (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA; University of Tennessee, Knoxville, TN, USA), Evert K. Holwerda (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA; Dartmouth College, Hanover, NH, USA), Richard J. Giannone (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA), Xiaoyu Liang (Dartmouth College, Hanover, NH, USA), Suresh Poudel, Joseph C. Ellis (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA), Yannick J. Bomble (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA; National Renewable Energy Laboratory, Golden, CO, USA. ), Robert L. Hettich y Lee R. Lynd (Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA) para Nature Communications (Vol. 13, núm. 3870, 2022), una revista multidisciplinar dedicada a la publicación de estudios sobre ciencias biológicas, física, química, salud y ciencias de la tierra. Esta es una publicación de Nature. Correo de contacto: [email protected]
Transport and instream removal of the Cry1Ab protein from genetically engineered maize is mediated by biofilms in experimental streams
Transporte y eliminación de la proteína Cry1Ab de maíz modificado genéticamente, mediados por biopelículas en corrientes experimentales
La mayoría del maíz cultivado en los Estados Unidos es genéticamente modificado para expresar propiedades insecticidas, incluyendo la proteína Cry1Ab, diseñada para generar resistencia contra Ostrinia nubilalis, conocida como el taladro del maíz europeo. Después de la cosecha del cultivo, estas proteínas pueden filtrarse en los arroyos adyacentes a partir de los detritos de los cultivos que quedan en los campos, por lo que resulta difícil identificar el destino ambiental de las proteínas Cry1Ab en hábitats acuáticos. En este estudio, fue realizada una combinación de experimentos de campo y escenarios de modelado para examinar la influencia del sustrato del fondo de un arroyo y las biopelículas asociadas a la eliminación de Cry1Ab presente en el agua.
Este artículo fue realizado por Arial J. ShogrenI, Jennifer L. Tank, Emma J. Rosi (Cary Institute of Ecosystem Studies, Millbrook, NY, United States of America), Martha M. Dee, Shannon L. Speir, Diogo Bolster (University of Notre Dame, Notre Dame, Indiana, United States of America) y Scott P. Egan (Rice University, Houston TX, United States of America) para PLoS ONE (Vol. 14, núm. 5, 2019), una revista sobre ciencias naturales, investigaciones en medicina, ingeniería, ciencias sociales y humanidades. Esta es una publicación de PLoS (San Francisco, California, US). Correo de contacto: [email protected].
- Video:Mejores prácticas de QM/MM: estudios sobre reacciones catalizadas por enzimas
- Fuente:BioExcel CoE
