In silico approach of antiviral compounds potentials for SARS-CoV-2 and SARS-CoV and drug-like property predictions

Enfoque in silico de potenciales compuestos antivirales para SARS-CoV-2 Y SARS-CoV y predicción de propiedades drug-like

Introducción: El SARS-CoV-2 (Coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo; anteriormente 2019-nCoV) y el SARS-CoV (coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo) son virus estrechamente relacionados, que no tienen tratamiento hasta ahora. Por lo tanto, la búsqueda de nuevas moléculas es esencial.

Objetivos: el objetivo de este estudio es utilizar un enfoque in silico para proponer compuestos antivirales potenciales para el SARS-CoV-2 y el SARS-CoV y predecir sus propiedades farmacológicas.

Materiales y métodos: Se realizó un moleculardocking utilizando AutoDock Vina con las moléculas que habían demostrado previamente propiedades drug-like. Posteriormente, se identificaron los aminoácidos y el tipo de interacción implicada en el complejo proteína-ligando.

Resultados: Se pudieron identificar seis candidatos potenciales disponibles en la base de datos PubChem capaces de interactuar con las proteasas 6U7 y 2GTB, que se unen al mismo sitio activo que el lopinavir y el remdesivir.

Conclusión: Las pequeñas moléculas con propiedades similares a las de los fármacos podrían utilizarse como antivirales, tras las evaluaciones experimentales.

INTRODUCCIÓN

Los coronavirus son grandes virus ARN monocatenarios positivos envueltos que infectan al ser humano, pero también a una amplia gama de animales [1]. Por su morfología de viriones esféricos con un núcleo central y proyecciones superficiales que recuerdan a una corona solar, se les denominó coronavirus [2]. Existen cuatro subfamilias, a saber, coronavirus alfa, beta, gamma y delta [1]. El tamaño del genoma varía entre 26 kb y 32 kb [3]. Entre los subtipos de coronavirus que pueden infectar al ser humano, los coronavirus beta pueden causar enfermedades graves y la muerte, mientras que los coronavirus alfa provocan infecciones asintomáticas o levemente sintomáticas [1]. El coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2) pertenece al linaje B de los beta-coronavirus y está estrechamente relacionado con el virus SARS-CoV [1]. Hay cuatro proteínas estructurales principales codificadas por el genoma coronaviral en la envoltura, una de las cuales es la proteína espiga (S) que se une al receptor de la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) y media en la posterior fusión entre la envoltura y las membranas de la célula huésped para ayudar a la entrada viral en la célula huésped [2].

El mundo se enfrenta actualmente a una pandemia de SRAS-CoV-2, declarada por el Comité de Emergencias de la Organización Mundial de la Salud (OMS) el 11 de marzo de 2020, basándose en el aumento de las tasas de notificación de casos en diferentes países.