Proteína LIC10494 de Leptospira interrogans serovar Copenhageni: modelo estructural y regiones funcionales asociadas

Protein LIC10494 of Leptospira interrogans serovar Copenhageni: structural model and associated functional regions

Objetivo. Predecir computacionalmente la estructura tridimensional de la proteína antigénica LIC10494 e inferir las regiones funcionales asociadas importantes para su antigenicidad e inmunogenicidad. Materiales y métodos. Se realizó un análisis computacional de la estructura primaria de LIC10494 a partir de los servidores BLAST, PROTPARAM, PROTSCALE, DAS, SOSUI, TOPPRED, TMAP, TMPRED, SPLIT4, PHDHTM, TMHMM2, HMMTOP2, GLOBPLOT y PROSITE. La estructura secundaria se obtuvo por consenso de los algoritmos SOPM, PREDATOR GOR4, DPM y DSC. La aproximación a la estructura terciaria se obtuvo con el algoritmo MUSTER. La minimización de energía se obtuvo a partir del campo de fuerza AMBER94 de la suite de análisis molecular SCHRODINGER, y la validación tanto estereoquímica como energética del modelo se realizó con el servidor RAMPAGE. El modelo final fue visualizado con el programa PyMol v.0,98. Resultados. En el presente estudio se propone un modelo computacional que detalla la estructura tridimensional de la lipoproteína hipotética LIC10494 y está de acuerdo con reportes experimentales previos; el estudio demuestra la existencia de patrones que podrían tener un papel importante en la patogenicidad y la protección de la bacteria frente al sistema inmune del hospedero; la presencia de una región desordenada entre los aminoácidos 80 y 140; y la presencia de un segmento transmembrana entre los aminoácidos 8 y 22. Conclusión. La coincidencia entre segmentos estructurales y funcionales sugiere que el modelo puede usarse para predecir ciertos aspectos del comportamiento biológico de la proteína en cuanto a la patogenicidad e inmunogenicidad de la bacteria.

INTRODUCCIÓN

La Leptospirosis es una zoonosis infecciosa considerada como una enfermedad reemergente de comportamiento endémico, y de distribución mundial con brotes continuos en varios continentes (1). Datos estadísticos revelaron en el 2009 que la incidencia mundial de leptospirosis es de aproximadamente 1:100.000 habitantes en climas templados, 100:100.000 habitantes en climas húmedos tropicales y más de 100:100.000 habitantes en poblaciones con alto riesgo de exposición (www.who.org). En Latinoamérica, la leptospirosis humana ha alcanzado tasas superiores a 10:100.000 habitantes, y en Colombia se estimó una incidencia de 3:100.000 habitantes en el año 2008 de acuerdo a la notificación de casos realizada al Sistema Nacional de Vigilancia (Sivigila) (www.ins.gov.co). A causa de la gran cantidad de especies de mamíferos reservorios y la presencia de Leptospira interrogans en ambientes cálidos y húmedos, la leptospirosis es considerada la zoonosis más importante en el mundo (1).