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Caracterización fenotípica y molecular de aislados de Pseudomonas aeruginosa resistentes a fluoroquinolonas en Palestina
Las fluoroquinolonas son importantes agentes antimicrobianos para el tratamiento de las infecciones por Pseudomonas. Durante 2017, se recolectaron 11 aislados de P. aeruginosa de diferentes muestras clínicas de distintos centros médicos en Cisjordania Noroccidental, Palestina. En este estudio, se detectó la resistencia a las fluoroquinolonas y la secreción de β-lactamasas mediante métodos fenotípicos, mientras que la presencia de secuencias génicas de β-lactamasas y otros factores de virulencia se detectó mediante PCR. Se secuenció el producto de PCR de los genes gyrA, parC y parE para su posterior análisis. Los análisis filogenéticos, los índices de diversidad poblacional y la determinación de haplotipos se realizaron utilizando los programas informáticos MEGA versión 6, DnaSP 5.1001 y el algoritmo de unión de medianas del programa Network 5, respectivamente. Los resultados de este estudio mostraron que la CMI para ciprofloxacino y norfloxacino se ubicó en un rango de 32-256 µg/ml. Además, todos los aislados portaban genes exoT o exoT y exoY, diferentes genes de β-lactamasa, y el 82% de estos aislados albergaban integrones de clase 1. Los análisis de las secuencias de gyrA, parC y parE mostraron polimorfismo, alta diversidad de haplotipos (0,945-0,982), baja diversidad de nucleótidos (0,01225-0,02001) y un número de haplotipos de 9 para cada gen gyrA y parE, y 10 para el gen parC. Los haplotipos fundadores fueron Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) y Hap-6 (9,1%) para los genes gyrA, parC y parE, respectivamente. Dos de los haplotipos de ParE se detectaron como haplotipos indel. Las redes de unión a la mediana (MJ) construidas a partir de los haplotipos de estos genes mostraron una expansión en estrella. Las pruebas de neutralidad (prueba D de Tajima y prueba Fs de Fu) para estos genes arrojaron resultados negativos. Las cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a las fluoroquinolonas mostraron una CMI elevada para las fluoroquinolonas, productoras de β-lactamasa, portadoras de genes codificantes de exotoxinas de secreción tipo III, la mayoría de ellas con el gen de la integrasa I y un alto nivel de mutaciones en las regiones QRDR de los genes gyrA, parC y parE. Todos estos factores pueden desempeñar un papel importante en la invasividad de estas cepas y dificultar su tratamiento. El aislamiento de estas cepas en diferentes centros médicos indica la necesidad de una aplicación estricta de medidas de control de infecciones en los centros médicos del noroeste de Cisjordania, Palestina, con el objetivo de reducir los gastos y los daños causados por las infecciones por P. aeruginosa. Los análisis moleculares demostraron que los haplotipos palestinos de P. aeruginosa resistentes a las fluoroquinolonas no están genéticamente diferenciados; sin embargo, es posible que existan más mutaciones en estas cepas.
Autores: Adwan, G.; Omar, G.
Idioma: Inglés
Editor: Takako Matsumura-Tundisi
Año: 2022
Artículos
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Licencia
Atribución
Consultas: 5
Citaciones: Sin citaciones
Este documento es un artículo elaborado por Adwan, G., y Omar, G. (Universidad Nacional An-Najah, Palestina) para Brazilian Journal of Biology Vol. 82. Publicación de Instituto Internacional de Ecología. Contacto: bjb@bjb.com.br
Las fluoroquinolonas son importantes agentes antimicrobianos para el tratamiento de las infecciones por Pseudomonas. Durante 2017, se recolectaron 11 aislados de P. aeruginosa de diferentes muestras clínicas de distintos centros médicos en Cisjordania Noroccidental, Palestina. En este estudio, se detectó la resistencia a las fluoroquinolonas y la secreción de β-lactamasas mediante métodos fenotípicos, mientras que la presencia de secuencias génicas de β-lactamasas y otros factores de virulencia se detectó mediante PCR. Se secuenció el producto de PCR de los genes gyrA, parC y parE para su posterior análisis. Los análisis filogenéticos, los índices de diversidad poblacional y la determinación de haplotipos se realizaron utilizando los programas informáticos MEGA versión 6, DnaSP 5.1001 y el algoritmo de unión de medianas del programa Network 5, respectivamente. Los resultados de este estudio mostraron que la CMI para ciprofloxacino y norfloxacino se ubicó en un rango de 32-256 µg/ml. Además, todos los aislados portaban genes exoT o exoT y exoY, diferentes genes de β-lactamasa, y el 82% de estos aislados albergaban integrones de clase 1. Los análisis de las secuencias de gyrA, parC y parE mostraron polimorfismo, alta diversidad de haplotipos (0,945-0,982), baja diversidad de nucleótidos (0,01225-0,02001) y un número de haplotipos de 9 para cada gen gyrA y parE, y 10 para el gen parC. Los haplotipos fundadores fueron Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) y Hap-6 (9,1%) para los genes gyrA, parC y parE, respectivamente. Dos de los haplotipos de ParE se detectaron como haplotipos indel. Las redes de unión a la mediana (MJ) construidas a partir de los haplotipos de estos genes mostraron una expansión en estrella. Las pruebas de neutralidad (prueba D de Tajima y prueba Fs de Fu) para estos genes arrojaron resultados negativos. Las cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a las fluoroquinolonas mostraron una CMI elevada para las fluoroquinolonas, productoras de β-lactamasa, portadoras de genes codificantes de exotoxinas de secreción tipo III, la mayoría de ellas con el gen de la integrasa I y un alto nivel de mutaciones en las regiones QRDR de los genes gyrA, parC y parE. Todos estos factores pueden desempeñar un papel importante en la invasividad de estas cepas y dificultar su tratamiento. El aislamiento de estas cepas en diferentes centros médicos indica la necesidad de una aplicación estricta de medidas de control de infecciones en los centros médicos del noroeste de Cisjordania, Palestina, con el objetivo de reducir los gastos y los daños causados por las infecciones por P. aeruginosa. Los análisis moleculares demostraron que los haplotipos palestinos de P. aeruginosa resistentes a las fluoroquinolonas no están genéticamente diferenciados; sin embargo, es posible que existan más mutaciones en estas cepas.
Descripción
Las fluoroquinolonas son importantes agentes antimicrobianos para el tratamiento de las infecciones por Pseudomonas. Durante 2017, se recolectaron 11 aislados de P. aeruginosa de diferentes muestras clínicas de distintos centros médicos en Cisjordania Noroccidental, Palestina. En este estudio, se detectó la resistencia a las fluoroquinolonas y la secreción de β-lactamasas mediante métodos fenotípicos, mientras que la presencia de secuencias génicas de β-lactamasas y otros factores de virulencia se detectó mediante PCR. Se secuenció el producto de PCR de los genes gyrA, parC y parE para su posterior análisis. Los análisis filogenéticos, los índices de diversidad poblacional y la determinación de haplotipos se realizaron utilizando los programas informáticos MEGA versión 6, DnaSP 5.1001 y el algoritmo de unión de medianas del programa Network 5, respectivamente. Los resultados de este estudio mostraron que la CMI para ciprofloxacino y norfloxacino se ubicó en un rango de 32-256 µg/ml. Además, todos los aislados portaban genes exoT o exoT y exoY, diferentes genes de β-lactamasa, y el 82% de estos aislados albergaban integrones de clase 1. Los análisis de las secuencias de gyrA, parC y parE mostraron polimorfismo, alta diversidad de haplotipos (0,945-0,982), baja diversidad de nucleótidos (0,01225-0,02001) y un número de haplotipos de 9 para cada gen gyrA y parE, y 10 para el gen parC. Los haplotipos fundadores fueron Hap-1 (18%), Hap-2 (27,3%) y Hap-6 (9,1%) para los genes gyrA, parC y parE, respectivamente. Dos de los haplotipos de ParE se detectaron como haplotipos indel. Las redes de unión a la mediana (MJ) construidas a partir de los haplotipos de estos genes mostraron una expansión en estrella. Las pruebas de neutralidad (prueba D de Tajima y prueba Fs de Fu) para estos genes arrojaron resultados negativos. Las cepas palestinas de P. aeruginosa resistentes a las fluoroquinolonas mostraron una CMI elevada para las fluoroquinolonas, productoras de β-lactamasa, portadoras de genes codificantes de exotoxinas de secreción tipo III, la mayoría de ellas con el gen de la integrasa I y un alto nivel de mutaciones en las regiones QRDR de los genes gyrA, parC y parE. Todos estos factores pueden desempeñar un papel importante en la invasividad de estas cepas y dificultar su tratamiento. El aislamiento de estas cepas en diferentes centros médicos indica la necesidad de una aplicación estricta de medidas de control de infecciones en los centros médicos del noroeste de Cisjordania, Palestina, con el objetivo de reducir los gastos y los daños causados por las infecciones por P. aeruginosa. Los análisis moleculares demostraron que los haplotipos palestinos de P. aeruginosa resistentes a las fluoroquinolonas no están genéticamente diferenciados; sin embargo, es posible que existan más mutaciones en estas cepas.