Se estudió la diversidad de la ictiofauna de la presa de la Central Hidroeléctrica de Jebba (HEP), en Jebba, centro-norte de Nigeria. Se muestrearon peces durante 24 meses utilizando redes de enmalle, anzuelo y línea, y atarraya. Los individuos se identificaron mediante datos morfológicos y moleculares (subunidad I de la citocromo c oxidasa mitocondrial). Se registró un total de 9605 peces de agua dulce durante el período de muestreo. El uso de un enfoque taxonómico integrador permitió la identificación de 83 especies pertenecientes a 42 géneros. Además, el estudio registró tres especies no identificadas: Ctenopoma sp., Malapterurus sp. y Protopterus sp. Los análisis mostraron que los individuos pertenecientes a las familias Cichlidae y Mochokidae dominaban la presa. Los análisis de diversidad revelaron una diversidad de peces relativamente alta durante la temporada de lluvias en la sección aguas abajo de la presa de la Central Hidroeléctrica de Jebba, en comparación con la sección aguas arriba. Por lo tanto, el estudio demostró la presencia de una comunidad íctica diversa con una alta riqueza y diversidad de especies en la presa de la Central Hidroeléctrica Jebba. Finalmente, recomendamos un adecuado monitoreo y evaluación de la biodiversidad de peces de agua dulce en Nigeria. Además, se recomienda el uso de un enfoque taxonómico integrado para la identificación adecuada de especies y el estudio de peces de agua dulce en Nigeria.