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Virus de la vena amarilla de Alternanthera (AYVV); un begomovirus betasatélite independiente que infecta a Sonchus palustris en Pakistán
Los begomovirus asociados a satélites constituyen el grupo más diverso de virus vegetales en las regiones tropicales y subtropicales. En Pakistán, durante los estudios de campo realizados en 2019-2020, se observó que Sonchus palustris (una maleza) presentaba síntomas de begomovirus, como amarillamiento de las nervaduras y patrones de mosaico en las hojas. Se realizó una amplificación por círculo rodante a partir del ADN total aislado de hojas sintomáticas para amplificar los genomas virales circulares. La clonación y secuenciación posteriores mostraron que una nueva cepa del virus de la nervadura amarilla de Alternanthera (AlYVV) está asociada con el amarillamiento de las nervaduras de S. palustris. El análisis del porcentaje de identidad mediante la búsqueda BLAST y el análisis SDT mostró que la nueva cepa es 94-98% idéntica a los aislados de AlYVV reportados en Pakistán, India y China. En el árbol filogenético, se agrupó con AlYVV-[PK:E prostrata:15-KX710155], AlYVV-[PK:E prostrata:13]-KX906697] y AlYVV-[PK:E prostrata:11]-KX906694], previamente reportados en Pakistán. No se detectó un nivel de betasatélite ni de ninguna otra molécula satélite en las muestras estudiadas. El análisis filogenético de los genes Rep y CP de AlYVV con los genes correspondientes de virus estrechamente relacionados que circulan en el Sudeste Asiático mostró una recombinación intraespecífica que involucra tanto la región complementaria como la región sentido del virión del virus. El análisis de reloj relajado y el gráfico de horizonte bayesiano basado en las secuencias del gen CP indicaron tasas de sustitución ligeramente superiores (4,75 x 10⁻³ sustituciones/nucleótido/año). En el subcontinente indio, los begomovirus monopartitos asociados a satélites infectan predominantemente cultivos y plantas no cultivadas. Sin embargo, el AlYVV infecta principalmente plantas no cultivadas, independientemente de las moléculas satélite. Nuestra hipótesis es que el AlYVV evolucionó como un verdadero begomovirus monopartito en el subcontinente indio y podría representar una gran amenaza para los cultivos introducidos en condiciones adecuadas. Estos estudios son cruciales para comprender las probables epidemias futuras de begomovirus en la región.
Autores: Nawaz-Ul-Rehman, M. S.; Liaqat, I.; Nahid, N.; Saleem, F.; Alkahtanid, S.; Al Qahtani, A.; Ye, J.; Mubin, M.
Idioma: Inglés
Editor: Takako Matsumura-Tundisi
Año: 2022
Artículos
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Licencia
Atribución
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
Este documento es un artículo elaborado por Nawaz-Ul-Rehman, M. S., Liaqat, I., Nahid, N., Saleem, F., Alkahtani, S., Al Qahtani, A., Ye, J., y Mubin, M. (Universidad de Agricultura de Faisalabad, Universidad de Lahore, Universidad de Faisalabad, Pakistán, Academia China de Ciencias, Universidad King Saud y Hospital Especialista King Faisal, Arabia Saudita) para Brazilian Journal of Biology Vol. 82. Publicación de Instituto Internacional de Ecología. Contacto: bjb@bjb.com.br
Los begomovirus asociados a satélites constituyen el grupo más diverso de virus vegetales en las regiones tropicales y subtropicales. En Pakistán, durante los estudios de campo realizados en 2019-2020, se observó que Sonchus palustris (una maleza) presentaba síntomas de begomovirus, como amarillamiento de las nervaduras y patrones de mosaico en las hojas. Se realizó una amplificación por círculo rodante a partir del ADN total aislado de hojas sintomáticas para amplificar los genomas virales circulares. La clonación y secuenciación posteriores mostraron que una nueva cepa del virus de la nervadura amarilla de Alternanthera (AlYVV) está asociada con el amarillamiento de las nervaduras de S. palustris. El análisis del porcentaje de identidad mediante la búsqueda BLAST y el análisis SDT mostró que la nueva cepa es 94-98% idéntica a los aislados de AlYVV reportados en Pakistán, India y China. En el árbol filogenético, se agrupó con AlYVV-[PK:E prostrata:15-KX710155], AlYVV-[PK:E prostrata:13]-KX906697] y AlYVV-[PK:E prostrata:11]-KX906694], previamente reportados en Pakistán. No se detectó un nivel de betasatélite ni de ninguna otra molécula satélite en las muestras estudiadas. El análisis filogenético de los genes Rep y CP de AlYVV con los genes correspondientes de virus estrechamente relacionados que circulan en el Sudeste Asiático mostró una recombinación intraespecífica que involucra tanto la región complementaria como la región sentido del virión del virus. El análisis de reloj relajado y el gráfico de horizonte bayesiano basado en las secuencias del gen CP indicaron tasas de sustitución ligeramente superiores (4,75 x 10⁻³ sustituciones/nucleótido/año). En el subcontinente indio, los begomovirus monopartitos asociados a satélites infectan predominantemente cultivos y plantas no cultivadas. Sin embargo, el AlYVV infecta principalmente plantas no cultivadas, independientemente de las moléculas satélite. Nuestra hipótesis es que el AlYVV evolucionó como un verdadero begomovirus monopartito en el subcontinente indio y podría representar una gran amenaza para los cultivos introducidos en condiciones adecuadas. Estos estudios son cruciales para comprender las probables epidemias futuras de begomovirus en la región.
Descripción
Los begomovirus asociados a satélites constituyen el grupo más diverso de virus vegetales en las regiones tropicales y subtropicales. En Pakistán, durante los estudios de campo realizados en 2019-2020, se observó que Sonchus palustris (una maleza) presentaba síntomas de begomovirus, como amarillamiento de las nervaduras y patrones de mosaico en las hojas. Se realizó una amplificación por círculo rodante a partir del ADN total aislado de hojas sintomáticas para amplificar los genomas virales circulares. La clonación y secuenciación posteriores mostraron que una nueva cepa del virus de la nervadura amarilla de Alternanthera (AlYVV) está asociada con el amarillamiento de las nervaduras de S. palustris. El análisis del porcentaje de identidad mediante la búsqueda BLAST y el análisis SDT mostró que la nueva cepa es 94-98% idéntica a los aislados de AlYVV reportados en Pakistán, India y China. En el árbol filogenético, se agrupó con AlYVV-[PK:E prostrata:15-KX710155], AlYVV-[PK:E prostrata:13]-KX906697] y AlYVV-[PK:E prostrata:11]-KX906694], previamente reportados en Pakistán. No se detectó un nivel de betasatélite ni de ninguna otra molécula satélite en las muestras estudiadas. El análisis filogenético de los genes Rep y CP de AlYVV con los genes correspondientes de virus estrechamente relacionados que circulan en el Sudeste Asiático mostró una recombinación intraespecífica que involucra tanto la región complementaria como la región sentido del virión del virus. El análisis de reloj relajado y el gráfico de horizonte bayesiano basado en las secuencias del gen CP indicaron tasas de sustitución ligeramente superiores (4,75 x 10⁻³ sustituciones/nucleótido/año). En el subcontinente indio, los begomovirus monopartitos asociados a satélites infectan predominantemente cultivos y plantas no cultivadas. Sin embargo, el AlYVV infecta principalmente plantas no cultivadas, independientemente de las moléculas satélite. Nuestra hipótesis es que el AlYVV evolucionó como un verdadero begomovirus monopartito en el subcontinente indio y podría representar una gran amenaza para los cultivos introducidos en condiciones adecuadas. Estos estudios son cruciales para comprender las probables epidemias futuras de begomovirus en la región.